财务部门说我不能退税。我在另一家公司仍然有工资，如何解决这个问题

您可以申请退税处理，向主管税务机关申报。法律依据为《个人所得税法》相关规定，您需选择一处任职单位所在地税务机关进行申报，若不及时处理可能导致税收违规，影响个人信用。
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可申请退税。操作如下：1.确认自己所有任职单位；2.选择一处作为申报地，向该地税务机关提交退税申请；3.提供相关证明材料，如工资单、离职证明等；4.等待税务机关审核并处理退税事宜。若多处任职，需固定选择一处申报。
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常见处理方式为向税务机关申请退税并说明情况。若存在多处任职，需选择并固定向一处税务机关申报。选择时应考虑便利性、税收政策等因素。