但主管说不到一个小时的部分不算加班费，是否合法？

主管说法不合法，加班时间应如实计算加班费。依据《劳动法》，加班费计算需按实际加班时长，不得随意舍去。不及时处理可能导致劳动者权益受损，引发劳动争议。
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处理此类问题，可先与主管沟通，要求按实际加班时间计算加班费。若沟通无果，可向公司人事部门反映或申请劳动仲裁。选择方式时，需考虑效率与公正性。
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主管做法不合法。应对方式：1.与主管协商，指出其错误，要求按实际加班时间计算；2.若主管拒绝，可向公司人力资源部门投诉，并提供加班证据；3.如公司不予处理，可向劳动仲裁机构申请仲裁，维护自身合法权益。